Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5478D3Z6R0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5478D3Z6R0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5478D3Z6R0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5478D3Z6R0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5478D3Z6R0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5478D3Z6R0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5478D3Z6R0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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