Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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