Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc8D3YZV8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms