Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ccdc6D3YZP9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms