Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmf1B9EKI3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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