Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms