Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siah3B2RWG3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms