Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5483B2RV77 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms