Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf3B2RUQ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms