Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zscan5bB2RTN3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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