Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms