Protein–RNA interactions for Protein: B1AVN5

Zfp990, Zinc finger protein 990, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp990B1AVN5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zfp990B1AVN5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp990B1AVN5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms