Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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