Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm6880A3KG45 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms