Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms