Protein–RNA interactions for Protein: A2BFE8

Prrg1, Proline-rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg1A2BFE8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrg1A2BFE8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrg1A2BFE8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms