Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhl41A2AUC9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms