Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprfA2A8L5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprfA2A8L5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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