Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 2810403D21Rik-209ENSMUST00000207966 1433 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3238W4VSP7 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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