Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17190V9GX38 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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