Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt6bQ9Z331 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms