Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3bQ9Z321 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms