Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Hdac5Q9Z2V6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdac5Q9Z2V6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Hdac5Q9Z2V6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Hdac5Q9Z2V6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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