Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms