Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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