Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Cldn8Q9Z260 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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