Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms