Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms