Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms