Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited4Q9WUL8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms