Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms