Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptpn4Q9WU22 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms