Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf2Q9WTU0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms