Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TapbpQ9R233 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms