Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NrkQ9R0G8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms