Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphs1Q9QZS7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms