Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Col4a3Q9QZS0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Col4a3Q9QZS0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Col4a3Q9QZS0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Col4a3Q9QZS0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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