Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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