Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms