Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp1Q9QY53 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms