Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdzd4Q9QY39 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdzd4Q9QY39 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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