Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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