Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChmQ9QXG2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms