Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms