Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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