Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf1Q9JM58 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Crlf1Q9JM58 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms