Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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