Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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