Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cabp1Q9JLK7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms