Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn15Q9JLG8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn15Q9JLG8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms